Американским ученым удалось расшифровать эпигеном клеток человека, извещает Science Daily. Исследование провела группа сотрудников Лаборатории геномного анализа в Институте Солк (Salk Institute) под руководством начальника лаборатории, профессора Джозефа Экера (Joseph Ecker). Отчет об их работе опубликован в журнале Nature.
Активность генов определяется не только их последовательностью в молекуле ДНК, но и иными факторами, например, пространственной конфигурацией “двойной спирали” и ее метилированием. Термином “эпигеном” принято означать все факторы, определяющие какие из генов, сочиняющих геном, работают, а какие – отключены.
Сотрудники Лаборатории геномного анализа сосредоточились на изучении метилирования ДНК. Один из творцов исследования Райан Листер (Ryan Lister) разработал эффективный метод, дозволяющий не только обнаружить метильные группы в составе молекулы ДНК, но и составить схему их расположения в изучаемом геноме.
Исследователи расшифровали эпигеном эмбриональных стволовых клеток человека и клеток соединительной ткани легких (фибробластов). Выяснилось, что в геноме фибробластов большинство метильных радикалов располагалось рядом с цитозином. В ДНК стволовых клеток около 25 процентов метилирования происходило рядом с иными элементами двойной спирали.
Для подтверждения своих открытий исследователи сравнили эпигеномы эмбриональных стволовых клеток и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, полученных из фибробластов. Процент метильных радикалов, располагавшихся не у цитозина, совпадал в обеих группах клеток.
На следующем этапе исследований группа Экера планирует выучить воздействие эпигенетической структуры ДНК на развитие клеток, а также формирование ряда заболеваний. Кроме того, ученые желают оценить изменения эпигенома в процессе старения, а также под воздействием факторов окружающей среды.